《二二八事件檔案彙編》第31、32冊所收錄之檔案，係選編自臺南縣警察局、臺南市政府民政局、臺南市政府、軍管區司令部、內政部警政署、國防部史政編譯局，以及臺灣高等法院等檔案。本次編輯，係將上述檔案分類編排，計分為事件前的治安動態、事件後的綏靖清鄉、案犯逮捕與執行等三大主題，事件前的治案動態下分為警務行政、治安事件、日人徵用處理、防制奸偽等四項，事件後的綏靖清鄉分為清查武器、善後處理等二項，案犯逮捕與執行分為案犯逮捕、案犯審訊及執行、辦理自首自新等三項，目的在呈現憲警單位執行逮捕與審訊案犯之動態情況，補足史料之空白，以增進民眾對二二八地方史的認識。